Wiosną 1940 r., w wyniku decyzji najwyższych władz ZSRR, przeprowadzono mord na około 22 tys. polskich obywateli – w tym na ponad 10 tys. oficerów wojska i policji.
Decyzję o eksterminacji „wrogów władzy sowieckiej” podjęto 5 marca, natomiast pierwszy transport jeńców w celu ich likwidacji wyruszył 3 kwietnia z obozu w Kozielsku do Katynia. Wyroki wykonywali funkcjonariusze NKWD poprzez strzały z broni krótkiej w tył głowy.
Miejscami kaźni Polaków, którzy znaleźli się w sowieckiej niewoli, stały się:
- Katyń – od 3 IV do 12 V rozstrzelano tam ok. 4400 jeńców z obozu w Kozielsku;
- Charków – od 5 IV do 12 V zamordowano tam ok. 3800 jeńców z obozu w Starobielsku;
- Kalinin (Twer) – od 4 IV do 16 V przeprowadzono tam egzekucję na ok. 6300 więźniach obozu w Ostaszkowie (głównie policjantach i funkcjonariuszach KOP);
- Kijów, Charków oraz Chersoń – wymordowano tam 3435 jeńców z tzw. listy ukraińskiej, więzionych we Lwowie, Łucku, Równem, Tarnopolu, Stanisławowie i Drohobyczu. Ciała ukryto w różnych miejscach, w tym w Bykowni;
- Mińsk – przeprowadzono tam eksterminację 3870 więźniów z tzw. listy białoruskiej, których przetrzymywano w Białymstoku, Brześciu, Pińsku, Baranowiczach i Wilejkach. Zwłoki pomordowanych ukryto prawdopodobnie w Kuropatach.
Z obozów w Kozielsku, Starobielsku i Ostaszkowie ocalało łącznie 395 polskich oficerów, których wywieziono do obozu w Juchnowie, a potem do obozu NKWD w Griazowcu.
Ofiarami zbrodni katyńskiej byli również Krotoszynianie, między innymi żołnierze batalionu zapasowego 56 Pułku Piechoty Wielkopolskiej, który utworzono z nadwyżek mobilizacyjnych i w sile około 1500 żołnierzy wysłano do Ośrodka Zapasowego 25 Dywizji Piechoty w Kielcach. Lista ofiar sowieckich oprawców (zapewne niepełna), które związane były z ziemią krotoszyńską została wyryta na Krzyżu Katyńskim, znajdującym w kwaterze wojskowej krotoszyńskiego cmentarza parafialnego. Została ona sporządzona we współpracy z Lidią Ławniczak i rodzinami pomordowanych:
KOZIELSK – KATYŃ
- BANASIEWICZ Teodor – ppor. Wojska Polskiego, ur. w Sulmierzycach w 1899 r., powstaniec wielkopolski;
- CIEMNOCZOŁOWSKI Edmund - ppor. rez., ur. w Rogowie w 1902 r., nauczyciel, rodzina w Krotoszynie;
- DŁUGOSZ Mieczysław – ppor. rez., ur. 1910 r., nauczyciel z Głuchowa k. Pogorzeli;
- DRECKI Edmund - por. Wojska Polskiego, ur. w Miłosławiu w 1897 r., powstaniec wielkopolski, nadleśniczy w Krotoszynie;
- FIBAK Leonard – ppor. rez. 70 pp. w Pleszewie, ur. 1903 r., absolwent Gimnazjum w Krotoszynie, farmaceuta;
- GIDASZEWSKI Stanisław – ppor. lotnictwa, ur. 1913 r., absolwent Gimnazjum w Krotoszynie, mieszkaniec Kromolic;
- HASCHEK Franciszek – ppor. 56 pp., ur. 1914 r., absolwent Gimnazjum w Krotoszynie;
- JANDA Wacław – ppor. rez. 69 pp. w Gnieźnie, ur. 1887 r., nauczyciel z Gorzupi pow. Krotoszyn;
- KOWALCZYK Adam – kpt. sł. st. 56 pp., ur. 1894 r., delegowany na kwatermistrza w 3 pp. KOP w Augustowie;
- LUDWICZAK Edward – por. rez. 17 p. uł. w Lesznie, ur. w Krotoszynie w 1911 r., absolwent SN w Krotoszynie, nauczyciel;
- NAWROCKI Władysław – kpt. sł. st. 56 pp., ur. w Krotoszynie w 1891 r., komendant PW i WF w Gostyniu;
- PAWŁOWSKI Jan Baptysta– por. rez. 22 p. uł. w Brodach, ur. 1909 r., notariusz zamieszkały w Krotoszynie;
- ROBACZYK Józef– ppor. rez. 75 pp. w Chorzowie, ur. 1908 r., absolwent SN w Krotoszynie, nauczyciel;
- SINIECKI Władysław – por. rez., ur w Koźminie w 1903 r.;
- SYNORADZKI Telesfor– por. san. rez., lekarz internista, dyrektor szpitala w Koźminie;
- TETZLAFF Bronisław– por. rez., ur. w Dzielicach pow. Krotoszyn w 1895 r., prawnik;
- WOŁOSIANKO Michał – kpt. 56 pp., ur. 1901 r., lekarz internista;
- WORONOWICZ Edward– por. rez. Wojska Polskiego, ur. 1897 r., starosta powiatu koźmińskiego z lat 1927 – 28;
- WÓJCIKIEWICZ Zbigniew Kajetan – ppor. rez. 55 pp. w Lesznie, ur. 1907 r., urzędnik, rodzina w Krotoszynie;
OSTASZKÓW – MIEDNOJE (TWER)
- ANDRZEJEWSKI Władysław – post. Policji Państwowej w Krotoszynie, ur. 1900 r., zamieszkały w Wyganowie;
- GĄTOWSKI Franciszek – post. Policji Państwowej w Łucku, ur. 1894 r., pochodził z Koźmina;
- JANCZAK Ignacy – post. Policji Państwowej, ur. 1902 r., rodzina w Krotoszynie;
- KOZIETULSKI Przemysław, Piotr – por. sł. st. 56 pp., ur. 1911 r., delegowany do KOP, rodzina w Krotoszynie;
- KRAWCZYŃSKI Kazimierz – post. Policji Państwowej w Kobylinie, ur. w Kobylinie w 1913 r.;
- KUCZYŃSKI Piotr – post. Policji Państwowej, ur. w Smolicach pow. Krotoszyn w 1888 r.;
- MARCINIAK Józef – plut. sł. st. 9 pp. w Zamościu, ur. w Koźminie w 1901 r., rodzina w Koźminie;
- MICHALCZYK Antoni – st. przod. Policji Państwowej w Krotoszynie, ur. w Granówku w 1890 r.;
- WIERCIŃSKI Michał – przod. Policji Państwowej, ur. 1903 r., komendant posterunku w Witkowie, rodzina w Krotoszynie;
- WOJTASZEK Stanisław – post. Policji Państwowej w Krotoszynie, ur. 1910 r.;
STAROBIELSK – PIATICHATKI (CHARKÓW)
- CHODKIEWICZ Stanisław – por. rez. 56 pp. z ośrodka zapasowego 25 Dywizji Piechoty, ur. we Lwowie w 1902 r.;
- CHYŁKA Feliks – ppor. rez. 60 pp. w Ostrowie Wielkopolskim, ur. 1915 r., lekarz z Ustkowa pow. Krotoszyn;
- CIĄŻYŃSKI Teodor – por. 7 p. strz. kon. w Poznaniu, urodzony w Pleszewie w 1895 r., syn dzierżawcy z Ustkowa;
- CYNKUTIS Edward – ppor. 41 pp. w Suwałkach , urodzony 1901 r., urzędnik, rodzina w Krotoszynie;
- DOROSZ Stanisław – ppor. sł. st. 56 pp. w Krotoszynie/65 pp. w (?), ur. w Rajtarowie w 1911 r.;
- FILODA Franciszek – ppor. rez. 56 pp., ur w Wojciechowie w 1895 r., handlowiec;
- FRĄCKOWIAK Ignacy – ppor. rez. 70 pp. w Pleszewie, ur. 1907 r., nauczyciel z Zalesia Wielkiego, rodzina w Krotoszynie;
- GIBASIEWICZ Jan – por. rez. 56 pp., ur. w Krotoszynie w 1900 r., wiceburmistrz Krotoszyna;
- HECHMANN Jan – ppor. rez. 56 pp., ur. 1901 r., zamieszkały w Krotoszynie kupiec;
- JABŁECKI Edward – por. 56 pp., ur. 1909 r.;
- KAPAŁA Józef – kpt. sł. st. 56 pp., ur. 1898 r., zamieszkały w Krotoszynie;
- KUNA Marian Tadeusz – por. sł. st. 56 pp., ur. 1909 r., zamieszkały w Krotoszynie;
- LEJA Józef – ppor. rez. 56 pp. oraz 60 pp. w Ostrowie Wlkp. z ośrodka zapasowego 25 Dywizji Piechoty, ur. 1907 r.;
- LEWIŃSKI Czesław – mjr sł. st. 56 pp., dowódca batalionu zapasowego z ośrodka zapasowego 25 DP, ur. 1897 r.;
- MALINOWSKI Piotr – ppor. rez. 56 pp., ur. 1909 r., urzędnik Dyrekcji Okręgowej Kolei Państwowych;
- MOCEK Czesław – mjr sł. st. 56 pp., mieszkaniec Krotoszyna;
- NABZDYK Stanisław – ppor. 56 pp., ur. w Lutogniewie w 1895 r., zamieszkały w Lutogniewie;
- OFIERZYŃSKI Konrad – ppor. rez. 56 pp. z ośrodka zapasowego 25 DP, ur. w Poznaniu w 1909 r.;
- OTTO Jan August – ppor. rez. 56 pp. z ośrodka zapasowego 25 DP, ur. w Piaskach w 1912 r.;
- PLEWA Jarosław – ppor. 56 pp. z ośrodka zapasowego 25 DP w Kielcach, ur. 1913 r., zamieszkały w Zdunach;
- ROBACZYK Stanisław – ppor. rez. 56 pp., ur. w Krotoszynie w 1915 r., absolwent SN w Krotoszynie, nauczyciel;
- SIKORA Stanisław – kpt. sł. st. 56 pp. z ośrodka zapasowego 25 Dywizji Piechoty, ur. 1895 r.;
- SUMIŃSKI Tadeusz – por. san. rez., ur. 1905 r., absolwent Gimnazjum w Krotoszynie, farmaceuta;
- SZÓSTAK Antoni – ppor. rez. 56 pp., ur. w Salni w 1912 r., zamieszkały w Salni, student medycyny UP;
- ŻERDZIŃSKI Edmund – ppor. rez. 56 pp., ur. 1914 r., urzędnik Zakładu Ubezpieczeń Społecznych w Poznaniu;
tzw. UKRAIŃSKA LISTA KATYŃSKA
- MAJCHERKIEWICZ Stanisław – ur. w Koźminie w 1898 r.;
- ZIÓŁKOWSKI Antoni – post. Policji Państwowej w Krotoszynie i Ligocie (pow. Krotoszyn), ur. 1906 r.